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【Nature Protocols】类器官-脑片共培养模型:Core2Edge——从肿瘤核心到单细胞浸润的全人源GBM模型

胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)最棘手的生物学特征之一,是肿瘤细胞并不局限于影像学可见的肿瘤主体,而会沿脑实质弥漫浸润,并通过细长的肿瘤微管(tumor microtubes,TMs)形成相互连接、具有治疗抵抗特征的细胞网络。手术能够切除肿瘤核心,却难以清除远端浸润细胞,这构成GBM复发的重要基础。

然而,传统二维培养无法重现三维肿瘤网络和脑组织微环境;肿瘤球体缺少宿主脑组织;小鼠模型存在物种差异;脑类器官共培养虽然提供了三维背景,但其组织成熟度通常更接近胎儿脑。如何在全人源体系中同时保存肿瘤核心、浸润轨迹、细胞状态异质性与成人脑微环境,仍是GBM模型研究中的关键难题。

德国波恩大学医院等多机构团队在《Nature Protocols》发表Core2Edge方法学论文:将患者来源胶质母细胞瘤类器官(glioblastoma organoids,GBOs)植入成人来源的人器官型脑片,并结合组织扩增、光片荧光显微成像、空间转录组和多重蛋白成像,建立从肿瘤核心一直延伸至单细胞分散区的全人源ex vivo模型。

一、模型亮点


与常见的GBM体外模型相比,Core2Edge有以下几个值得关注的特点:

  • 全人源组织组合:患者来源GBO保留肿瘤的三维结构与转录异质性,人器官型脑片则提供成人来源的灰质、白质及多类脑驻留细胞。

  • 覆盖完整浸润轴:可区分肿瘤核心、近端浸润区(near infiltration zone,NIZ)和远端浸润区(far infiltration zone,FIZ),并追踪至单细胞分散。

  • 保留网络形态:组织扩增结合光片荧光显微镜(LSFEM)可在完整样本尺度上重建TMs连接的三维肿瘤网络。

  • 兼容空间多组学:固定石蜡包埋样本可用于Xenium空间转录组和CODEX多重蛋白成像,比较不同浸润区域的肿瘤状态及微环境。

  • 可设置治疗窗口:植入后24小时的首次换液起可加入药物,并结合形态、LDH、组织学和空间读出评估区域性反应;但原文尚未完成系统性药效或临床药敏预测验证。

二、研究设计


该方案以“人脑片制备 + GBO选择与标记 + 白质区植入 + 短期共培养 + 多尺度终点分析”为主线。GBO需在脑片制备前建立稳定培养;植入后模型最多培养约10天,再根据研究目标进入组织学、空间组学或LSFEM流程。

01  人器官型脑片制备(Day0)

脑组织通常来自癫痫手术或神经肿瘤切除,取材后尽快交接并使用振动切片机制备脑片。新鲜组织的完整性、切除过程中的热损伤以及处理延迟,都会直接影响后续培养质量。

02  GBO筛选与荧光标记(Day1)

选择直径400-900 μm、外形圆整、颜色较浅且无明显坏死的GBO。常规模型使用CellBrite绿色胞质膜染料预标记,以便在脑片中识别和操作;如用于LSFEM,则需提前完成ZsGreen稳定标记和重新聚集培养。

03  GBO入人脑片(Day1)

在荧光体视显微镜下确定植入位点,优先选择白质或灰白质交界区域。使用微钩形成浅切口,以微铲将单个GBO推入切口,随后让组织自然回弹并包裹植入物。

04  共培养与处理(Days1-11)

植入后先静置恢复,24小时后首次换液;此后每48小时换液,培养总时长不超过10天。药物可从首次换液阶段加入,培养上清可用于LDH细胞毒性检测。

05  固定与下游分析(Days 3-11)

根据实验目的进行甲醛固定、石蜡包埋或速冻。下游可选择常规组织学与免疫染色、Xenium空间转录组、CODEX空间蛋白成像、单细胞测序或LSFEM三维成像。

图1 | Core2Edge的整体实验流程:人脑片制备、细胞注射或GBO植入、共培养与处理、固定,以及LSFEM和空间组学等下游分析。

  • 整体时间:在GBO已准备好的前提下,脑片制备、植入、培养和固定约需7-12天。

  • 前置时间:患者来源GBO的建立通常需要4-6周;若进行LSFEM,GBO转导、重新聚集及样本扩增成像还会额外增加数周。

  • 关键窗口:模型培养不宜超过约10-12天,因为脑片活力及免疫、血管成分会随时间逐步下降。

三、实验步骤


1

制备并初步质控人脑片(Day 0)

脑组织应在切除后尽快送达实验室,原文建议2小时内开始处理。切片前去除多余液体并将组织块稳固粘接于振动切片机托盘;切片后排除碎裂、坏死、明显水肿或带有手术损伤孔洞的区域。

2

筛选并染色GB0 (Day1,约1.5小时)

在解剖显微镜下选择15-20个大小相近、直径400-900 μm的健康GBO。用钝化宽口P1000吸头转移,CellBrite染液需新鲜配制并完全覆盖类器官;在37 ℃、5% CO₂、120 r.p.m.条件下孵育30分钟,随后清洗3次并置于冰上,尽快进入植入步骤。

3

建立入位点并固定GB0(约2小时)

将脑片insert转移至培养皿,吸去大部分培养液但避免组织干燥。选择白质区,用微钩轻柔形成足以容纳GBO的浅切口,再以微铲推入类器官。切口应自然回弹包裹GBO;若闭合不充分,可用微钩钝端轻调组织。

4

植入后恢复与共培养

植入后先让脑片恢复2分钟,再缓慢转回培养板;随后10-15分钟内避免移动培养板。37 ℃、5% CO₂静置培养24小时后收集不超过500 μl上清并更换2 ml预温培养基,此后每48小时换液,最长培养10天。

5

设置药物处理与活力监测

药物可从植入后24小时的首次换液开始加入,并在后续换液时维持相应处理。LDH结果反映整个脑片-GBO体系的细胞损伤,不能单独区分宿主脑细胞与肿瘤细胞,因此宜结合荧光面积、组织学和区域化分子读出解释。

6

组织固定与空间分析

用于组织学、Xenium和CODEX的样本可进行甲醛固定及石蜡包埋;计划单细胞分析时可选择速冻。用于LSFEM的样本需完成GBO预标记、固定、通透、可选免疫染色、水凝胶包埋、消化和约1.5倍组织扩增,再进行光片成像及三维重建。


四、常见问题及解决方案


Core2Edge同时涉及新鲜人组织、类器官转移、显微植入和大体积成像,任何一个环节的偏差都可能影响最终结果。

问题一:脑片制备后容易碎裂或培养状态不稳定?

  • 原因分析:初始组织质量不佳,或组织切除后处理延迟;电凝、吸引和水肿也可能损害组织结构。

  • 解决方案:与神经外科团队建立快速交接流程,尽量在切除后2小时内开始处理;切片前评估组织完整性,避免使用碎裂、坏死或明显受损区域。

问题二:GBO在转移或染色过程中受损、荧光过弱?

  • 原因分析:吸头过窄或边缘尖锐、GBO未被染液完全覆盖、染料浓度不合适,或类器官在冰上停留过久。

  • 解决方案:使用钝化宽口吸头,并预先用培养基润滑;选择直径不超过900 μm的GBO;新鲜配制CellBrite染液并确保类器官完全浸没。部分染色已足以辅助植入,不必追求所有细胞均匀强荧光。

问题三:切口撕裂、GBO植入后弹出或转移时脱落?

  • 原因分析:切口过深、操作过于用力、培养液残留过多导致组织移动,或植入后未给予足够稳定时间。

  • 解决方案:保持脑片湿润但不完全浸没,以轻柔浅切口容纳GBO;用微钩钝端调整组织使切口闭合,植入后恢复2分钟,回板后再静置10-15分钟并避免震动。

问题四:LSFEM通透不足、抗体穿透差或背景噪声高?

  • 原因分析:样本较厚、通透时间不足、CHAPS溶液失效或封闭体系与抗体不匹配。

  • 解决方案:使用新鲜CHAPS缓冲液;对较厚样本逐步延长通透和抗体孵育时间,必要时延长至3-4天;封闭血清应与二抗宿主来源匹配,并为扩增后的样本预留足够工作距离。

五、模型鉴定


Core2Edge的鉴定不能只看GBO是否留在脑片中。原文从整体活力、浸润距离、组织整合、三维网络形态和空间细胞状态等多个层面验证模型。


鉴定策略一:生长、活力与组织整合

【鉴定方法】连续活细胞成像量化肿瘤核心直径及“核心+浸润”径向范围;同步检测培养上清LDH,并以H&E、NeuN、GFAP和KP1等组织学/免疫标志物评估脑片结构和GBO整合。

【预期结果与科学解释】在不超过10天的培养窗口内,LDH未显示模型整体细胞毒性增加。GBO逐步扩大并向周围组织浸润。以GBO no. 26为例,核心直径中位数由第2天892 μm增加至第10天1,025 μm;“核心+浸润”径向距离在第10天达到1,465 μm。上述数据来自有限样本,主要用于证明模型具有可量化的生长与浸润行为。

图2 | GBO植入后的整体活力、生长与浸润动态。核心直径变化相对有限,而“核心+浸润”范围随培养时间增加。


鉴定策略二:三维网络与浸润分区

【鉴定方法】对固定样本进行组织扩增和LSFEM成像,依据肿瘤细胞密度划分核心、NIZ与FIZ,并在Imaris中重建肿瘤细胞及TMs,量化区域体积、浸润距离和TM长度。

【预期结果与科学解释】LSFEM可在完整模型中识别从致密核心到单细胞分散区的连续浸润轨迹。个别肿瘤细胞可在距GBO中心最远2,730 μm处检测到;部分TMs向邻近皮质延伸,最长可达750 μm。样本2的TM平均长度为150 ± 117 μm。

图3 | Core2Edge的LSFEM三维成像:GBO核心、NIZ、FIZ及浸润前沿的TM网络。


鉴定策略三:空间细胞状态与微环境

【鉴定方法】使用Xenium进行空间转录组检测,以CODEX开展多重蛋白成像,并结合Seurat注释细胞类型、Neftel框架划分GBM细胞状态,同时比较NIZ与FIZ的内皮和髓系标志物。

【预期结果与科学解释】代表性数据集中,少突胶质细胞占66.3%,免疫细胞占7.7%,内皮细胞及周细胞占7.2%,肿瘤细胞占4.3%。AC-like和MES-like状态主要富集于肿瘤核心,OPC-like和NPC-like状态在浸润前沿更常见;后两类细胞的侵袭评分较高,而前两类细胞的网络连接性相对更强。

图4 | Core2Edge的空间转录组与多重蛋白成像:细胞组成、肿瘤状态分布及NIZ/FIZ微环境。


鉴定策略四:模型适用范围与边界

【模型适用范围】可用于研究GBM浸润、TMs网络、肿瘤-脑微环境互作及不同空间区域的治疗反应;也可作为患者来源GBO的功能测试平台,并减少部分动物实验。

  • 组织来源限制:依赖高质量的新鲜人脑与肿瘤组织,供体差异及取材质量会影响重复性。

  • 异体配对:GBO与脑片通常来自不同供体;因GBO建立需4-6周而脑片仅能短期存活,难以完成自体配对。

  • 培养时间有限:超过约12天后脑片活力和细胞多样性下降,免疫及血管成分尤其容易衰减。

  • 缺少系统循环:模型保留原有血管结构但无灌注,也缺少循环免疫细胞,不能完整模拟免疫募集、血管重塑和肿瘤细胞外渗。

  • 药效证据边界:本论文以方法建立和可行性验证为主,尚不能据此认定Core2Edge已具有临床药敏预测能力。

六、结语


Core2Edge的价值,不在于简单地把GBO放到脑片上,而在于建立一条可操作、可量化的全人源路径,把肿瘤核心、浸润边缘、单细胞分散和宿主脑微环境连接起来。

其重复性依赖几个关键节点:新鲜脑组织的快速处理,直径400-900 μm且无坏死的GBO筛选,白质区的轻柔植入,最长约10天的共培养窗口,以及与研究问题匹配的组织学、三维成像或空间组学终点。

需要强调的是,Core2Edge仍是短期、异体、无灌注的ex vivo模型,不能等同于完整的人体GBM,也不能仅凭本研究推断临床药物反应。未来若能提高组织来源稳定性、引入灌注及循环免疫成分,并在更大规模的患者样本中完成药效和临床结局验证,将更有利于其在机制研究与精准治疗评价中的应用。


参考文献

Melhem, A., Pregler, B. E. F., Rodriguez-Gatica, J. E., et al. (2026). Core2Edge: a human glioblastoma organoid-brain slice model capturing infiltration and transcriptional heterogeneity from core to single-cell dispersion. Nature Protocols. https://doi.org/10.1038/s41596-026-01412-3